در کودکان مبتلا به میکروزومی کرانیوفاشیال، بخشی از صورت کوچکتر از حد نرمال است. معمولا بر گوش و فک تاثیر می گذارد. همچنین می تواند روی چشم ها، گونه ها و استخوان های گردن تاثیر بگذارد.علت اصلی ایجاد آن از بین رفتن زود هنگام سلولهای نورال کرست طی مهاجرت می باشد